不同类型的除尘器在进行使用时会不同的除尘效果，设备对于运行状况不稳定或者是波动较大的除尘系统，在使用时需要注意其烟气处理量变化对除尘效率的影响，正常运行时，除尘器的效率高低是袋式除尘器、电除尘器及文丘里除尘器等设备。
除尘器在选择时有效的根据其气体的性质来进行选择，在使用时必须要考虑气体的风量、温度、成分以及湿度等因素，电除尘器适合于大风量、温度<400℃的烟气净化，在使用时不会受到其烟气量大小的限制。
烟气应冷却降温后方可使用袋式除尘器；袋式除尘器不宜处理高湿度和含油污的烟气净化；易燃易爆的气体净化适合于湿式除尘器；旋风除尘器的处理风量有限，当风量较大时，可采用多台除尘器并联的方式。
除尘器在使用时不会受到其粉尘以及电阻的影响，其粉尘的浓度和粒度对除尘器效率的影响是非常显著的，但对袋式除尘器的影响不显著；当气体的含尘浓度较高时，电除尘器前宜设置预除尘装置
除尘器的清灰方式和过滤风速取决于粉尘的性质；湿式除尘器不适合于净化憎水性和水硬性的粉尘：粉尘的真密度对重力除尘器、惯性除尘器和旋风除尘器的影响显著；对于新附性大的粉尘，易导致除尘器工作面猫结或堵塞，因此，不宜采用干法除尘；粉尘净化遇水后，能产生可燃或有爆炸危险的混合物时，不得采用湿式除尘器。
